Dra. Maria Eugenia Farias

Áreas de investigación

  • Microbiología ambiental ecosistemas extremos Andinos.
  • Diagnóstico de ecosistemas microbianos extremos en zonas de influencia de minería en la Puna.
  • Geomicrobiología.
  • Resistencia estrés ambiental en ecosistemas microbianos (UV-As). Biomineria
  • Colección de cultivos (Arqueas, Bacterias, Cianobacterias, Hongos, unicelulares), ecosistemas y ADN de ecosistemas bajo riesgo ambiental

Publicaciones relevantes

Rascovan, N., Maldonado, M.J.,  Vazquez, M.P., Farías, M.E. 2015. Bioenergetic use of arsenic in haloarchaea biofilms from Diamante Lake. ISMEJ doi:10.1038/ismej.2015.109

Rasuk, Maria Cecilia Daniel Kurth, Regina Flores, Manuel Contreras, Fernando Novoa, Daniel Poire and Maria Eugenia Farias 2015 Bacterial diversity in microbial mats and sediments from Atacama Desert. Microbial Ecology DOI: 10.1007/s00248-015-0649-9

Strategies and approaches in plasmidome studies—uncovering plasmid diversity disregarding of linear elements? Julián R. Dib, Martin Wagenknecht, María E. Farías and Friedhelm Meinhardt 2015 doi: 10.3389/fmicb.2015.00463. Front. Microbiol doi: 10.3389/fmicb.2015.00463

Kurth, D., Belfiore, C., Gorriti, M., Farias, M.E., Albarracín, V.H. 2015. Genomic and proteomic evidences unravel the UV-resistome of the poly-extremophile Acinetobacter sp. Ver3. Front. Microbiol. 6:328. doi:10.3389/fmicb.2015.00328

Omar Federico Ordoñez, Esteban Omar Lanzarotti, Daniel G Kurth, Néstor Cortez, Maria Eugenia Farias, Adrian Gustavo Turjanski 2015 Genome comparison of two Exiguobacterium strains from high altitude andean lakes with different arsenic resistance: Identification and 3D modeling of the Acr3 efflux pump. Front. Environ. Sci.  doi: 10.3389/fenvs.2015.00050

Julian Rafael Dib, Angel Angelov, Wolfgang Liebl, Johannes Döbber, Sonja Voget, Jörg Schuldes, Marta Gorriti, Maria Eugenia Farías, Friedhelm Meinhardt, Rolf Daniel 2015 Complete Genome Sequence of the Linear Plasmid pJD12 Hosted by Micrococcus sp. D12, Isolated from a High-Altitude Volcanic Lake in Argentina Genome Announcements 06/2015; 3(3):e00627-15. DOI:10.1128/genomeA.00627-15

Urbano SB, Di Capua C, Cortez N, Farías ME, Alvarez HM 2014 Triacylglycerol accumulation and oxidative stress in Rhodococcus species: differential effects of pro-oxidants on lipid metabolism. Extremophiles. 18:75-384

Farías ME, Contreras M, Rasuk MC, Kurth D, Flores MR, Poiré DG, Novoa F, Visscher PT. 2014. Characterization of bacterial diversity associated with microbial mats, gypsum evaporites and carbonate microbialites in thalassic wetlands: Tebenquiche and La Brava, Salar de Atacama, Chile. Extremophiles 18:301-329.

Burguener GF, Maldonado MJ, Revale S, Fernández Do Porto D, Rascován N, Vázquez M, Farías ME, Marti MA, Turjanski AG 2014. Draft Genome Sequence of the Polyextremophilic Halorubrum sp. Strain AJ67, Isolated from Hyperarsenic Lakes in the Argentinian Puna.  Genome Announc.doi: 10.1128/genomeA.01096-13.

Albarracín, V.H., Simon, J., Pathak, G., Valle, L. Douki, T., Cadet, J., Borsarelli, C., Farias, M.E., Gärtner, W. 2014. First characterisation of a CPD-Class I photolyase from an UV-resistant extremophile isolated from High-Altitude Andean Lakes. Photochemical and Photobiological Sciences. 13, 739-750.

Rasuk, Maria Cecilia Daniel Kurth, Regina Flores, Manuel Contreras, Fernando Novoa, Daniel Poire and Maria Eugenia Farias 2014. Microbial characterization of a gypsum endoevaporitic ecosystem in Salar de Llamara Chile. Microbial Ecology, Oct;68(3):483-94.

Gorriti MF, Díaz GM, Chimetto LA, Trindade-Silva AE, Silva BS, Mesquita MMA, Gregoracci GB, Farías ME, Thompson CC, Thompson F 2014. Genomic and phenotypic attributes of salinivibrios from stromatolites, sediment and water of the high altitude Andean Lake Socompa. BMC Genomics, 15:473.

Fernández Zenoff M. V., M. C. Estevez, M. E. Farias (2014). Diurnal variation in bacterioplankton composition and DNA damage in the microbial community from an Andean oligotrophic lake | Ed: Predari, S.C. | Buenos Aires | 2014 Revista Argentina de Microbiología. En Prensa.

Belfiore C. Ordonez O. Farias Maria E. 2013 "Proteomic Approach of Adaptive Response to Arsenic Stress in Exiguobacterium sp. S17. An Extremophile Strain Isolate from High Altitude Andean Lake Stromatolite.  Extremophile 17(3):421-31.

Julian Rafael Dib, Jörg Schuldes, Andrea Thürmer, María E. Farias, Rolf Daniel, Friedhelm Meinhardt 2013. Complete Genome Sequence of pAP13, a Large Linear Plasmid of Actinobacterium Isolated from a Saline Lake at 4,200 m Above Sea Level in Argentina  GenomeA. DOI:10.1128/genomeA.00885-13

 Julian Rafael Dib, Jörg Schuldes, Andrea Thürmer, María E. Farias, Rolf Daniel, Friedhelm Meinhardt 2013. First Complete Sequence of a Giant Linear Plasmid from a Micrococcus Strain isolated from an Extremely High-Altitude Lake GenomeA DOI:10.1128/genomeA.00885-13

Susana Bequer Urbano, Virginia H. Albarracín, Omar F. Ordoñez, María E. Farías, Héctor M. Alvarez 2013. Lipid storage in High-Altitude Andean Lakes extremophiles and its mobilization under stress conditions in Rhodococcus sp. A5, an UV-resistant actinobacterium. Extremophile 17(2):217-27.

Dib Julián Rafael, Wolfgang Liebl, Martin Wagenknecht María Eugenia Farías and Friedhelm Meinhardt 2013.Extrachromosomal genetic elements in Micrococcus Applied Microbiology and Biotechnology Applied Microbiology and Biotechnology 97:63-75

Farías María Eugenia, Nicolas Rascovan, Diego Toneatti, Virginia Albarracín, Regina Flores, Omar Ordoñez, Daniel Poiré, Mónica M. Collavino, O. Mario Aguilar,  Martin Vazquez and Lubos Polerecky 2013 Discovery of Stromatolites Developing under Extreme Conditions in the Andeans Lakes. PLOS ONE 8(1): e53497. http://www.plosone.org/article/info:doi/10.1371/journal.pone.0053497

Ricardo M. Palma Diego A. Kietzmann Graciela S. Bressan, Javier Martín-Chivelet José López-Gómez, María E. Farias, María P. Iglesias Llanos. 2013. Peritidal cyclic sedimentation from La Manga Formation (Oxfordian) Neuquén Basin, Mendoza, Argentina. Journal of South American Earth Sciences. Año: 2013 vol. 47 p. 1 – 11

Ordoñez Omar; Gorriti Marta F.; Nestor Cortez; Farias Maria Eugenia; Adrian Turjanski 2013 Genome Sequence of the poli-extremophilic Exiguobacterium sp. S17, isolated from hyperarsenic lakes, in the Argentinean Puna. Genome Announcements doi:pii: e00480-13.10.1128/genomeA.00480-13.

Abarracín, V.H., Gärtner, W., Farias, M.E., 2013. UV Resistance and Photoreactivation of Extremophiles from High-Altitude Andean Lakes. Photobiological Sciences Online (KC Smith, ed.)  HYPERLINK "http://www.photobiosci.info/Albarracin.html"

German Burguener, Marcos Maldonado, Santiago Revale, Darío Fernández Do Porto, Nicolás Rascován, Martín Vázquez, Maria Eugenia Farias, Marcelo Marti, and Adrian Turjanski.2013 Genome Sequence of the poli-extremophilic Halorubrum sp. AJ67, isolated from hyperarsenic lakes, in the Argentinean Puna. GenomeA (01096-13)

Lynch R.C., A.J. King, P. Sowell, Mariá E. Farias, Christian Vitry, and S.K. Schmidt 2012. A preliminary assessment of the potential for microbial life in the highest elevation (>6000 m.a.s.l.) soils of the Atacama region. J Geophys Research 117:1-10.

Albarracín, V.H., Pathak, G., Douki, T., Cadet, J., Borsarelli, C., Gärtner, W. Farias, M.E. 2012 Extremophilic Acinetobacter strains from High-Altitude Lakes in Argentinean Puna: Remarkable UV-B Resistance and Efficient DNA Damage Repair. Origin of Life and Evolution of Biospheres 42:201-21.

Formación en recursos humanos 

Dirección de Investigadores CONICET (2)

Dra. Virginia H. Albarracín Beca Postdoctoral CONICET Tema: “Mecanismos fotoprotectores de bacterias extremófilas aisladas de Lagunas de Altura del Noroeste Argentino”. Investigador Adjunto concurso 2009 ACTUAL BECARIO MARIE CURIE CON ESTE TEMA

Dr Julian Dib Tema: Genomica y diversidad de plasmidos y su implicancia en la dispersión horizontal de genes en comunidades microbianas en humedales de altura del NOA ACTUAL BECARIO HUMBOLDT CON EL MISMO TEMA

Tesis doctorales dirigidas y terminadas (4)

Dr Julian Rafael Dib tesis y beca doctoral CONICET 2004-2009 Biodiversidad de plasmidos y su implicancia en la dispersión horizontal de genes en comunidades microbianas en humedales de altura del NOA Director: Dra Maria E Farias. Fecha de defensa 21-12-09 Clasificación: 10 sobresaliente 

Dr Omar Ordoñez: tesis- Beca CONICET 2007-2012. Tema: factores am bientales extremos en ecosistemas microbianos de  humedales altoandinos: mecanismos de adaptación

Bqca Verónica Fernandez Zennof tesis y beca doctoral CONICET 2004-2012 (finalizada) Tema: Estudios de Sistemas de Resistencia a Radiación Ultravioleta (RUV) en Bacterioplancton de Lagunas de Altura de los Andes (Nro de Expte Fac Bqca Qca y Farm UNT 51752-04) (Terminada, en proceso de presentación final). 

Dra. Regina Flores: tesis Beca CONICET 2007-2011. Tema: Estudios del efecto de la Radiación Ultravioleta sobre la biodiversidad bacterioplanctónica de lagunas de altura  de la Puna Argentina. Clasificación 9

Dirección de Posdoctorado (8)

Dra Cristina Estevez beca posdoctoral PICT 2006-2007 Tema: Dispersión Por Transferencia Horizontal De Genes De Interés Biotecnológico En Comunidades Microbianas De Ambientes Extremos De Altura Del NOA.

Dra Virginia H. Albarracin CONICET- DAAD-beca proyecto: Max Planck PICT-2006-01090 Tema: “Photophysical, photochemical and photobiological properties of light-inducibleflavoproteins”. 2008-2010 Alemania 2008-2009

Dra. Virginia H. Albarracín Beca Postdoctoral CONICET Tema: “Mecanismos fotoprotectores de bacterias extremófilas aisladas de Lagunas de Altura del Noroeste Argentino”. 2009-2011. 

Dr Julian Rafael Dib: Beca CONICET 2010-2012. Biodiversidad de plasmidos y su implicancia en la dispersión horizontal de genes en comunidades microbianas en humedales de altura del NOA Director: Dra Maria E Farias

Dra. Regina Flores: Beca CONICET 2011-2013. Tema: Estudios del efecto de la Radiación Ultravioleta sobre la biodiversidad bacterioplanctónica de lagunas de altura  de la Puna Argentina.

Dr. Daniel G. Kurth: Beca CONICET 2011-2013. Tema: “Búsqueda de enzimas de interés clínico en el metagenoma de ecosistemas de lagunas de altura de La Puna Andina”.

Dra. Carolina Belfiore: Beca CONICET 2011-2013. Tema: "Respuesta a estrés de bacterias hiperhalófilas y comunidades bacterianas de humedales altoandinos"

Dra Victoria Curia. INTI 2011-2012. Aplicaciones biotecnologicas de bacterias en mineria de Li K y Mg.

Dirección actual de Beca y Tesis doctoral (8)

Bqca Verónica Fernandez Zennof tesis y beca doctoral CONICET 2004-2012 (finalizada) Tema: Estudios de Sistemas de Resistencia a Radiación Ultravioleta (RUV) en Bacterioplancton de Lagunas de Altura de los Andes (Nro de Expte Fac Bqca Qca y Farm UNT 51752-04) (Terminada, en proceso de presentación final). 

Lic Javier M. Maldonado Beca CONICET (Programa de Becas para Áreas de Vacancia Geográfica) 2011-2013. Tema: Biodiversidad de Archeobacterias en ambientes extremos de los Andes. Sistemas de resistencia al estrés y aplicaciones biotecnologicas

Lic. Diego M. Toneatti Beca Doctoral CONICET 2010-2013. Tema: Metagenómica de Biodiversidad y metabolismo de tapetes microbianos y estromatolitos de la Puna (Argentina).

Lic. Marta F. Gorriti. Beca ANPICyT 2009-2012. Tema: Respuesta biológica modulada por luz en microorganismos extremófilos de lagunas alto-andinas

Lic Cesar Medina beca tipo II CONICET 2012-2014. Cianobacterias de ambientes extremos de la Puna

Lic Cecilia Rajuk beca tipo I CONICET 2012-2015. Genomica de ecositemas microbiano altoandinos (Tolar Grande Salta)

Lic Flavia Boidi beca tipo I CONICET 2012-2015. Estromatolitos de Laguna Negra Catamarca: Genomica y geoquímica

Lic Lorena Valle UNSE (codirección) 

Dirección  Tesina de grado (4)

Lic en biotecnología Agustin Paz Determinación De Polifosfatos En Bacterias Aisladas De Ambientes Extremos2009

Lic en biotecnología Regina Flores “Producción y bioacumulación de compuestos que absorben RUV (Mycosporine like amino acids - MAAs) en organismos planctónicos de agua marina” 2004-2005 (Resol.H C D: 12/05).

Lic Annika Weiss TU Berlin Alemania Dispersion of Culturable Antibiotic Resistant Bacteria by Flamingos in Isolated and Extreme Environments of High Altitude Andean Wetlands 2008 eingereicht an der Technischen Universität Berlin, Fachgruppe Umweltmikrobiologie.

Lic Ana Newman TU Berlin Alemania Studies by  DGGE of total communities of  Antibiotic Resistant Bacteria of High Altitude Andean Wetlands 2008 eingereicht an der Technischen Universität Berlin, Fachgruppe Umweltmikrobiologie.

Intercambio de Colaboración Científica

  • Alemania. MPI Mulhein Dr Gaertner
  • Alemania MPI Bremen Dr Polerecky
  • Alemania Universidad de Munster Dr Meinhardt
  • España Csic CIMEDEA Dr Rosello Mora
  • Brasil Cidade Universitária Rio de Janeiro /RJ/ Brasil Dr LopesThompson
  • Argentina INDEAR Dr Martin Vazquez
  • Argentina UNLP Dr Poire
  • Argentina IBR Dr Cortez
  • Argentina UNPSJB Dr Alvarez
  • Argentina SEGEMAR Dra Celeda
  • Argentina INTI Dra Cappa